Thermotogota o Thermotogae es un filo de bacterias. Son termófilos o hipertermófilos cuyas células se envuelven en una membrana exterior adicional. Son Gram negativos anaerobios que metabolizan carbohidratos. Las distintas especies tienen distintas tolerancias a la sal y al oxígeno. La cepa SL1 de Thermotoga subterranea fue encontrada en un depósito continental profundo de petróleo a 70 °C en East Paris Basin, Francia. Es un organismo anaerobio que reduce cistina y tiosulfato a sulfuro de hidrógeno. La tinción Gram negativa se debe a la característica estructura de la cubierta llamada "toga", sin embargo presenta una sola membrana lipídica, por lo que técnicamente es considerada una bacteria monodérmica.​